Performances des boucles sous R

J'assure mon cours de "Programmation R" en Master à cette époque de l'année. Lorsque j'aborde la question des boucles, je dis traditionnellement que ce n'est pas une bonne idée, le temps d'exécution étant souvent prohibitif. Je conseille aux étudiants de modifier leur code de manière à exploiter les aptitudes des fonctions de la famille des apply. Nous réalisons ensuite une série d'exercices pour voir comment ce type d'adaptation pourrait se mettre en place.

J'ai dû relativiser cette affirmation dans la période récente, parce que l'interpréteur R a énormément progressé avec les versions 3.4.0 puis 3.5.0. Depuis la 3.4.0 notamment, les boucles sont maintenant compilées à la volée (just-in-time), améliorant considérablement les temps de traitement sans que l'on ait à modifier en quoique ce soit notre code.

J'avais par le passé étudié les outils et astuces pour programmer efficacement sous R. Dans ce tutoriel, nous nous pencherons plus en détail sur la question des boucles en comparant les performances de la structure for() avec une solution passant par un sapply(). Je prendrai comme prétexte la programmation de l'algorithme de tri par sélection pour illustrer mon propos.

Mots-clés : logiciel R, langage R, programmation, sapply, boucles

Didacticiel : Boucles sous R

Code source : Loop in R

Références :

R. Rakotomalala, "Cours de Programmation R".

Tutoriel Tanagra, "Programmer efficacement sous R", février 2019.