Analyse Discriminante Linéaire sous R

En rédigeant mon précédent tutoriel consacré à l'analyse discriminante sous Python, je me suis rendu compte que je n'avais jamais écrit d'équivalent pour R, où l'on passerait en revue les fonctionnalités de la fonction lda() du package MASS qui fait référence sous cet environnement. C'est étonnant, surtout que je la pratique depuis un bon moment déjà. C'est même une des premières méthodes de R que j'ai explorées avec glm() et rpart(). Nous allons essayer d'y remédier dans ce document.

Nous reprenons la trame de la présentation pour Python, en prenant appui toujours sur notre support de cours dédié, mais en l'adaptant bien sûr aux spécificités de lda(). Notre référence reste SAS, avec les procédures proc discrim et proc candisc. Un des enjeux fort sera de faire le lien entre les parties descriptives et prédictives en dérivant les fonctions de classement à partir des fonctions canoniques discriminantes.

Mots-clés : logiciel R, analyse discriminante linéaire, analyse discriminante prédictive, ADL, linear discriminant analysis, lda, package MASS, sélection de variables, package klaR, stepdisc, logiciel SAS, proc discrim, proc candisc

Didacticiel : ADL sous R

Données et code source R : Kirsch - Mirabelle - Poire

Références :

R. Rakotomalala, "Analyse discriminante linéaire".
Tutoriel Tanagra, "Analyse discriminante linéaire sous Python", avril 2020.

Tutoriel Tanagra, "Analyse discriminante linéaire - Comparaisons de logiciels", juillet 2012.